خانه کلاهدوزها با هدف نشان دادن هوشمندی کویرنشینان در استفاده و تامین آب، از سال 1379 تاکنون میزبان موزه آب یزد بوده است. سه طبقه زیرزمینی و دو طبقه‌ای که روی زمین خانه قرار دارند همچون گنجینه‌ای ارزشمند، بخش‌هایی مجزا برای روایت الفبای آبادانی کویر دارند. هنگام بازدید از پایین‌ترین طبقه زیرزمین، شاهد ردپای دو قنات کهن‌سال هستیم. در طبقه بالاتر، سردخانه و محل نگهداری آذوقه و مواد غذایی اهل خانه را مشاهده می‌کنیم که هوای بسیار مطبوعی دارد. طبقه سوم از زیرزمین بخش اصلی و تماشایی موزه آب به شمار می‌رود که در آن سیر تکامل روش‌های تامین آب در یزد، اولین ساعت آبی دنیا، اسناد مربوط به خرید و فروش و اوقاف آب، ظروف و ابزار قدیمی اندازگیری حجم آب به نمایش درآمده‌اند. طبقه همکف بنا همان سکونت‌گاه خانواده کلاهدوز بوده که علاوه بر اتاق‌های پنج‌دری و گچکاری‌های بی‌نظیرش، آب‌انباری قدیمی دارد که در گذشته توسط چاه‌خانه‌ای واقع در پشت‌بام خانه سیراب می‌شد. تالار آینه در طبقه آخر بنا از بخش‌های تماشایی موزه محسوب می‌شود که معماری شاخص و آینه‌کاری چشم‌نوازی دارد. این موزه در نزدیکی مجموعه امیرچخماق، هتل داد، هتل لاله، بازار خان و مسجد جامع یزد قرار دارد.